作物進(jìn)化不僅受到自然選擇的影響,人為馴化和改良也是作物進(jìn)化的重要力量。桃子作為一種多年生的經(jīng)濟(jì)作物,其在馴化和改良過(guò)程中的遺傳改變尚未被很好的解析。
近日,Plant Biotechnology Journal在線發(fā)表了中國(guó)農(nóng)科院鄭州果樹研究所王力榮和曹珂研究員為通訊作者的題為"Comparativepopulation genomics identified genomic regions and candidate genesassociated with fruit domestication traits in peach"的研究論文。該研究利用全基因組重測(cè)序?qū)?18份桃種質(zhì)資源進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)劃分并證實(shí)了桃進(jìn)化過(guò)程中的馴化事件。
該研究找到了132個(gè)遺傳馴化和106個(gè)遺傳改良過(guò)程的選擇位點(diǎn),特異組織表達(dá)模式進(jìn)一步表明在遺傳馴化階段,馴化上調(diào)基因更多的出現(xiàn)在果實(shí)和種子中;而在遺傳改良階段,改良上調(diào)基因更多的出現(xiàn)在葉片和種子中;全基因組分析挖掘到21個(gè)果實(shí)馴化性狀相關(guān)的148個(gè)遺傳位點(diǎn),在關(guān)聯(lián)位點(diǎn)中,3個(gè)候選基因顯著與果實(shí)的重量,山梨醇和兒茶酸含量相關(guān);關(guān)聯(lián)多酚和糖含量的SNP頻率表明,在桃進(jìn)化過(guò)程中,多酚成分高的等位基因頻率在降低,而糖含量高的等位基因頻率在升高,這表明培育營(yíng)養(yǎng)豐富的桃可以通過(guò)與野生種的雜交提升桃子的多酚而不破壞糖酸的平衡。該研究為桃進(jìn)化和關(guān)鍵農(nóng)藝性狀的研究提供了基因組學(xué)基礎(chǔ)。
桃馴化和改良過(guò)程中的全基因組選擇位點(diǎn)篩選
該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研究開發(fā)項(xiàng)目(2018YFD1000200),農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新項(xiàng)目(CAAS-ASTIP-2016-ZFRI-01),中央公益性科學(xué)機(jī)構(gòu)基礎(chǔ)研究(1610192017101,1610192018102)和新西蘭植物與食品研究所支持。
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